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揭示肠道virome在人类健康和疾病
道左*
内科及药物治疗学讲座教授,消化疾病研究所国家重点实验室的消化道疾病,路健康科学研究所、香港中文大学,香港,中国
*通信地址:道左、医学和治疗消化疾病研究所国家重点实验室的消化道疾病,路健康科学研究所、香港中文大学、香港、中国、电子邮件:Tao.Zuo@cuhk.edu.hk
日期:提交:2018年1月10日;批准:2018年1月18日;发表:2018年1月19日
本文引用:左t揭幕肠道virome在人类健康和疾病。Int中国微生物学报。2018;2:001 - 003。https://doi.org/10.29328/journal.ijcv.1001002。DOI:10.29328 / journal.ijcv.1001002
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介绍
由于高通量测序技术的进步,肠道vriome正日益被视为肠道微生物组的一个重要组成部分,在病毒生物实体的数量被认为远比细菌种群[1,2]。人类virome主要是由噬菌体、动物细胞病毒、逆转录病毒和病毒引起持久和潜伏感染。集体他们包含一个更加多样化的基因实体比肠道细菌(3、4)。虽然在肠道的构成是猛进地透露,他们的角色在人类健康在很大程度上仍未知。不可否认,某些肠道病毒对人类健康有害的。然而,有趣的是,肠病毒在某些情况下,可以概括的有利影响共生的细菌通过不同的机制,包括调节宿主天然免疫与适应性免疫[5 - 7]。
一个健康的人类肠道virome由噬菌体主要,温带dsDNACaudovirales和ssDNAMicroviridae潜伏性感染细菌宿主,当压力产生后代,可能导致其他细菌感染和死亡[8]。没有疾病,肠道噬菌体个人之间表现出显著的多样性和暂时稳定[8 10]。噬菌体可以坚持主机粘液提供non-host-derived免疫力,保持肠道细菌检查[12]。粪便微生物群移植(FMT)艰难梭状芽胞杆菌感染已经证明了,当更多的噬菌体类群从供体转移到收件人,有利的治疗效果观察,而供体粪便噬菌体丰富可能影响治疗反应[13],表明肠道phageome人类健康的重要性。此外,现在人们意识到新的治疗策略的补充抗生素,使用噬菌体,虽然结果仍然是惊人的[14]。
许多研究表明肠道病毒失调疾病(2、15、16),尤其是噬菌体。尽管如此,这仍然是未知的疾病特性改变肠道virome大量的疾病。噬菌体组成变化可能对细菌微生物群生态的影响。噬菌体是细菌的主要动力健身和多样性在不同生态系统[17]。裂解细菌释放的脂质有关,核酸,蛋白质,作为其分子模式(pamp)触发炎症反应诱导细胞因子,细胞浸润和组织损伤。肠道微生物对噬菌体入侵敏感,导致特定肠道细菌的丰度的变化[18]。在胃肠道中,噬菌体负责水平转移细菌种群之间的遗传成分,包括那些对抗生素耐药性和疾病发病机理(18 - 20)。
人类virome发展迅速,由于不同条件和强调赋予宿主和环境(3 8研讨会)。目前,我们知之甚少的功能和角色在人类健康和疾病,肠道virobiota进一步实验探索virobiota-host和virobiota-other组件交互的肠道微生物群是必要的。此类研究持有的承诺产生深刻的理解复杂的人类生理学和微生物群落之间的关系,从而为制定新的战略奠定基础改善人类健康。
引用
- 处女HW。Virome在哺乳动物生理学和疾病。细胞。2014;157:142 - 150。Ref。https://goo.gl/YRtWsi
- 梳理SR,戴维斯N,待遇l .评论文章:人类肠道virome在健康和疾病。食物杂志。2017;46:800 - 815。Ref。https://goo.gl/k1dtxk
- 奥美拉,琼斯BV。人类肠道virome:多方面的多数。在微生物学前沿。2015;6:918。Ref。https://goo.gl/6imc97
- Lecuit M, Eloit M .人类virome:新的工具和概念。微生物学的趋势。2013;21日:510 - 515。Ref。https://goo.gl/jf55PZ
- 杨司法院,Min-Soo金姆,尤金·金,JH千,Yong-Soo李,et al .肠病毒改善肠道炎症通过toll样受体3和toll样受体7-Mediatedβ干扰素生产。免疫力。2016;44:889 - 900。Ref。https://goo.gl/k5iWbW
- Kernbauer E,丁Y, Cadwell k .肠病毒可以替代的有益功能共生的细菌。大自然。2014;516:94 - 98。Ref。https://goo.gl/kXfpXS
- Duerkop英航,Hooper LV。居民病毒及其与免疫系统相互作用的。免疫学性质。2013;14:654 - 659。Ref。https://goo.gl/H9DVVk
- 迈诺特,亚历山德拉布赖森,Christel Chehoud,加里·D吴,詹姆斯D·刘易斯,et al。快速进化的人类肠道virome。美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国。2013;110:12450 - 12455。Ref。https://goo.gl/JcxFHs
- 迈诺特、格伦伯格,吴GD,刘易斯JD,布什曼FD。人类肠道virome高变的位点。美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国。2012;109:3962 - 3966。Ref。https://goo.gl/jCKA5j
- Alejandro雷耶斯,马修·海恩斯弗洛伦特·E安利格,尼科尔·汉森安德鲁·C希思et al .病毒粪便微生物群的同卵双胞胎和他们的母亲。大自然。2010;466:334 - 338。Ref。https://goo.gl/Pzwc5G
- 艾莉森·沃勒,Takuji Yamada说大卫·M Kristensen Jens Roat Kultima, Shinichi Sunagawa et al .噬菌体类群的分类和量化人类肠道基因组。Isme杂志。2014;8:1391 - 1402。Ref。https://goo.gl/pB4BUU
- 杰里米·J Barra,丽塔Auroa, Mike Furlana卡特琳L Whitesona玛塞拉L Erb, et al .噬菌体坚持粘液提供non-host-derived免疫力。美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国。2013;110:10771 - 10776。Ref。https://goo.gl/jjGzqY
- 严道左,黄阳光H,长K Lam拉希德卢伊猫张,et al .噬菌体转移在粪便微生物群移植与梭状芽胞杆菌感染的治疗反应相关。胃肠病学》2017。152:140 - 141。Ref。https://goo.gl/UBx9w8
- 业务,Torres-Barcelo C我。进化理由噬菌体作为抗生素的补充。微生物学的趋势。2016;24:249 - 256。Ref。https://goo.gl/XDeVVo
- 杰森·M·诺曼,斯科特·汉德里,梅根T Baldridge林赛所有权,凯瑟琳Y刘,等。针对疾病改变肠Virome在炎症性肠病。细胞。2015;160:447 - 460。Ref。https://goo.gl/nkvXH3
- 道左,阳光明媚的黄H,开尔文Lam拉希德卢伊猫张,et al .噬菌体感染梭状芽胞杆菌转移在粪便微生物群移植与治疗相关的结果。肠道微生物群。2017年。Ref。https://goo.gl/HwGQcN
- Brussow H, Canchaya C,哈特WD。噬菌体和细菌病原体的进化:从基因组重组溶原性转换。微生物学和分子生物学评论。2004;68:560 - 602。Ref。https://goo.gl/bKXZ7r
- 雷耶斯,吴M, Mc Nulty NP, Rohwer说道FL,戈登霁。小鼠在人类肠道phage-bacterial主机动力学模型。美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国。2013;110:20236 - 20241。Ref。https://goo.gl/oNsj8Z
- 张YF,勒特里。转导bla (CMY-2),春节(A),春节从肠道沙门氏菌血清亚种(B)血清型S-Typhimurium海德堡。兽医微生物学,2008;129:418 - 425。Ref。https://goo.gl/7NRAUM
- Elisa Maiques Carles Ubeda,苏珊娜Campoy, Noelia萨尔瓦多,马德里拉萨、等人beta-lactam抗生素诱导的SOS反应和水平转移金黄色葡萄球菌毒力因素。细菌学期刊。2006;188:2726 - 2729。Ref。https://goo.gl/5SgY4m
- 金女士,Bae JW。空间扰动改变肠道粘膜和鲁米那viromes食源性肥胖的老鼠。环境微生物学。2016;18:1498 - 1510。Ref。https://goo.gl/xFtXJB
- 撒母耳迈诺特,罗西尼Sinha,小君陈,李Hongzhe苏Keilbaugh,等。人类肠道virome: Inter-individual变化和动态响应的饮食。基因组研究。2011;21日:1616 - 1625。Ref。https://goo.gl/kyvFBW
- Efrem Lim,燕郊周、国研赵厄玛K·鲍尔,林赛所有权,et al。早期生活动力的人类婴儿肠道virome和细菌微生物。自然医学。2015;21日:1228 - 1234。Ref。https://goo.gl/g6enGj