SARS-CoV-2 COVID-19疾病与持续- rt - pcr试验

作品简介:COVID-19疾病暴发的有一个伟大的临床和微生物的影响在过去的几个月里。在preanalytical阶段,收集的样本呼吸道在适当的时刻,从正确的解剖网站是必不可少的一个快速和精确的分子诊断假阴性率不到20%。

材料与方法:我们进行了描述性研究COVID-19疾病的持续负面rt - pcr检测患者的呼吸道疾病研究所(内心)在墨西哥城在2020年3月至5月期间。38例患者注册- rt - pcr测试通过鼻咽和口咽抽汲。我们与Shapiro-Wilk评估数据的分布正态性检验。非参数的数据报告与值。名义和序数变量的百分比。

结果:我们组的平均年龄是46岁,52.63%为男性(n= 20)。糖尿病是记录在34.21% (n= 13)的病人,系统性高血压21.05% (n= 8),31.57%(肥胖n= 42.10%(12)和超重n= 16)。接触烟草烟雾在47.36% (n= 18)的患者。氧气的初始饱和度中值是87%,室内空气。疾病的严重程度上承认是:温和的71.05% (n= 27),温和的21.05% (n= 8)和严重或7.89%的关键(n= 3)的情况下分别。63.15% (n= 24)寻求医疗症状后6天或更多的时间。记载了淋巴细胞减少78.94% (n= 30)。中LDH在录取的时候是300年,升高63.15% (n= 24)的病例。最初的胸部显示主要是磨砂玻璃的层析成像模式81.57% (n= 18.42%(31),主要整顿n= 7)。注册死亡率为15.78% (n= 6)。

结论:COVID-19和持续- rt - pcr检测患者致命的结果没有不同于其他COVID-19人口,因为他们现在相同的共享的其他危险因素患者淋巴细胞减少、并存病,海拔肺动脉栓塞和DHL入学以及层析COVID-19分数严重的疾病,但是我们可以表明患者的百分比高轻度的疾病在这些持续- rt - pcr检测。

疾病导致的小说SARS冠状病毒CoV-2 (COVID-19)迅速传播[1,2]。冠状病毒是一种异构群大单链RNA病毒,广泛分布在哺乳动物和鸟类和分组Coronaviridae家庭[3]。人类的主要群体利益是符合的α和β冠状病毒的细分Coronavirinaeγ和δ冠状病毒不被认为是人类病原体[4]。在21日的第二个十年的结束^圣世纪世界目睹了一种新的冠状病毒的爆发,被指定为SARS-CoV-2和分配给该物种分类学的严重急性冠状病毒相关的严重急性呼吸系统综合症(SARS - x)。Sarbecovirus类,Betacoronavirus流派(5、6)。创造的术语来指SARS-CoV-2病毒相关疾病COVID-19 [7]。呼吸道飞沫和密切接触被认为是COVID-19病毒的主要传播途径,尽管粪便-口腔路线不能排除(8 - 10)。

的临床场景COVID-19非常异构。疾病的光谱变化从非常轻微的症状表明中度和严重的上呼吸道感染形式如严重急性呼吸系统综合症(SARS) [11]。另外有报道称,无症状的情况下使感染的控制非常困难。

在感染患者SARS-CoV-2,几个条件与更高的易感性有关病毒和病毒载量升高COVID-19。SARS-Cov-2最高的积极成果是通过结合鼻咽和口咽拭取适当的处理后样品的指导方针疾病控制和预防中心(CDC)当样品获得在出现症状后的头几天考虑到最高的病毒载量已经记录在此期间增加诊断产量的逆转录酶聚合酶链反应试验(RTq-PCR)。

根据世界卫生组织(世卫组织),假阴性结果可高达32%的样品测试。相关的主要因素为这个样品的时间,应该是接近的开始症状时,病毒载量较高,获得样本不足和延迟的处理和运输样本[12]。

过程中记录,假阴性结果的疾病率随着时间的增加,高约9天的症状,它改变了又开始的21天症状(第二轮)的假阴性率达到高峰据一篇文章发表在梅奥诊所的公报中[13]。

我们进行了描述性研究在国家研究所的呼吸道疾病。我们回顾性分析临床、放射学和微生物与COVID-19感染住院的患者数据。在这项研究中我们分类COVID-19感染流行病学调查显示的定义COVID-19更新4月2020 +的典型层析结果暗示COVID-19流行病学上下文内的大流行。我们收集所有必要的信息来记录社会人口变量(年龄、居住地、并发症和吸烟史)以及实验室和层析数据。我们回顾了所有纳入本研究的患者的临床图表和消除那些不完整的图表。Excel作为分层的信息被存储在数据库中的数据的定义变量的函数。我们评估与Shapiro-Wilk de分布的数据正态性检验。非参数的数据报告与值。名义和序数变量的百分比。

共有38与COVID-19疾病住院- rt - pcr测试通过鼻咽和口咽擦在研究期间进行了分析。病人的平均年龄是46岁,男性占52.63%的情况下(n= 20)。关于糖尿病并发症在34.21%(记录n= 13)的病人,系统性高血压21.05% (n= 8),31.57%(肥胖n= 42.10%(12)和超重n= 16)。接触烟草烟雾在47.36% (n= 18)的患者。没有历史的癌症、慢性肾功能衰竭或肺部疾病。

获得的rt - pcr检测SARS-CoV-2通过鼻咽和口咽抽汲最初在100%(负n= 38)下套管。氧饱和度的中位数为87%呼吸室内空气。疾病的严重程度上承认是:温和的71.05% (n= 27),温和的21.05% (n= 8)和严重或7.89%的关键(n= 3)的情况下分别。

63.15% (n= 24)寻求医疗症状后6天或更多的时间。记载了淋巴细胞减少78.94% (n= 30)。中LDH在录取的时候是300年,升高63.15% (n= 24)的病例。最初的胸部显示主要是磨砂玻璃的层析成像模式81.57% (n= 18.42%(31),主要整顿n= 7)。注册死亡率为15.78% (n= 6)。

当前推荐的控制和预防中心(CDC)的诊断COVID-19是逆转录酶聚合酶链反应测试也称为rt - pcr测试(金标准)14 - 19[]这也是建议医生协调和表达他们的发现与当地政府在当前公共卫生指南。建议初始样本的呼吸道COVID-19疾病患者的诊断和检测的前5天内采取的胆囊疾病症状的出现,因为它已经证明在这一时期,存在高病毒载量的上、下呼吸道(20 - 24)。在我们的研究中使用的RT - PCR测试检测COVID-19是建议由世界卫生组织(世卫组织)和流行病学诊断和参考研究所的认证(里边的)。

的擦鼻咽和口咽经常推荐的诊断感染。虽然只有一个拭子的使用成为常态由于更好的耐心宽容,运营商安全和低成本,我们知道潜在的不便的这种做法在一些病人意识到这个链接到较低的RNA检测SARS-CoV-2和增加假阴性检测结果影响负面诊断和治疗决策。

王等人报道,擦的更频繁地使用口咽鼻咽路线在中国军团COVID-19爆发感染(25日- 27日)。RNA SARS-CoV-2,然而只有32%的口咽拭子中发现,速度明显低于63%的鼻咽拭子,一个是[28]。虽然建议的鼻咽和口咽的样本集合可以独立完成,发送两个样品一起在一个整除处理似乎是一个有吸引力的选择不影响结果。

我们现在知道,有时测试必须重复或样品必须从高度怀疑患者下呼吸道疾病的临床和层析结果的rt - pcr测试一直消极除了排除其他可能的病毒病原体,如季节性流感和合胞体呼吸道病毒[29]。

在我们的研究人群中,所有的患者遇到可疑情况的定义进行了测试通过鼻咽和口咽抽汲与rt - pcr和胸部x线断层摄影术。SARS患者初始rt - pcr - CoV-2检测流感A和B,流感H1N1 H5N3和其他呼吸道病毒获得了一个新的控制rt - pcr测试在48小时内如果接触的历史,临床和影像学数据和临床过程继续强烈建议COVID-19为主要诊断的诊断概率。

重复测试尤为重要,如果病人有病毒性肺炎的临床怀疑,历史的潜在风险和/或层析结果兼容COVID-19肺炎。在我们的研究中100%的患者至少一个第二次rt - pcr试验后48小时2和4之间的初始测试和一些测试完全取决于临床过程和医院住院时间。除了我们测试的第二个测试COVID-19病人Pneumonie支原体和衣原体等典型代理Pneumonie和患者急性呼吸窘迫综合征(ARDS)我们添加了支气管文化、血液和尿液文化以及军团菌尿抗原。

某些COVID-19肺炎患者具有高病毒载量的RNA SARS - CoV-2粪便以及延迟脱落病毒在呼吸道的临床过程[30-36]。患者的胃肠道表现已报告之前由于冠状病毒严重感染。因此,虽然文献建议采取直接从呼吸道样本选择的方法来检测SARS-CoV-2感染,在先进的情况下可以执行COVID-19直肠擦拭。在我们的机构不执行直肠擦拭[37]。

7天后血清转化似乎发生症状性感染在50%的情况下(共14天),但这不是随后迅速降低病毒载量(38、39)。血清学可能发挥重要作用的流行病学COVID-19,然而,即使在回顾证实感染血清学可能有用,在我们的机构中,截止今天,它不是被认为是标准的做法去做常规血清学检查患者的初始- rt - pcr测试(40、41)。

我们发现63.15%的患者寻求医疗护理6天或之后的开始症状,所有这些可能会导致假阴性结果的rt - pcr检测。

病人死于疾病的持续负面rt - pcr测试呈现以下特点:100%男性最初的淋巴细胞减少,肺动脉栓塞和LDH升高承认,吸烟史,高体重指数(BMI)和并发症的存在系统性高血压和2型糖尿病和他们也面对严重疾病的层析评估COVID-19(图1)。

研究中84.21%的患者由于临床改善排放。

COVID-19和持续- rt - pcr检测患者致命的结果没有不同于其他COVID-19人口,因为他们现在用同样的特征共享的其他特征患者淋巴细胞减少,并存病,海拔肺动脉栓塞和DHL入学以及层析COVID-19分数严重的疾病,但是我们可以表明患者的百分比高轻度的疾病在这些持续- rt - pcr检测。

不是一个多中心研究

病人的管理并不是均匀之外支持措施COVID-19症状。在研究期间的一些病人被包含在其他的研究项目。

我们没有执行在放电记录免疫球蛋白免疫血清学检验抗击非典——CoV-2证明出院患者真正面对一个新型冠状病毒感染或免疫。

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